概念
整块组织的组成混淆
对整块组织测得的分子读数同时反映各类细胞的比例与各类细胞自身的状态。当肿瘤细胞只占少数时,间质签名、免疫签名与「非肿瘤成分多少」高度共线,它们与结局的关联首先要怀疑是取样组成的关联。要注意两点:高度共线可以同时来自组成约束与真实的共同变化,光凭相关分不开;而不同队列里的「间质多少」若用的是不同测量(转录组签名分 vs 病理比例),其效应量不能合并成一个共同范围。
概念
对整块组织测得的分子读数同时反映各类细胞的比例与各类细胞自身的状态。当肿瘤细胞只占少数时,间质签名、免疫签名与「非肿瘤成分多少」高度共线,它们与结局的关联首先要怀疑是取样组成的关联。要注意两点:高度共线可以同时来自组成约束与真实的共同变化,光凭相关分不开;而不同队列里的「间质多少」若用的是不同测量(转录组签名分 vs 病理比例),其效应量不能合并成一个共同范围。